大型全自動食品微波殺菌設備包裝容器不能用金屬質地的， 需用介質材料， 一般用塑料軟包裝或玻璃，工程塑料質地容器為宜。為防止在微波殺菌過程中漲袋，設備可工業微波知識普及系列之醫藥 在工作倉內施加壓力采用反壓殺菌工藝，可防止漲袋損失。由于微波能是控制在金屬制成的干燥室內和波導管中工作，所以微波泄漏少，沒有放射線危害及有害氣體排放，不產生余熱和粉塵污染，既不污染食物，也不污染環境。
大型全自動食品微波殺菌設備應用人機界面和PLC可進行干燥過程和干燥工藝規范的可編程自動化控制。與傳統干燥方式*不同。它是使干燥物料本身成為發熱體，不需要熱傳導的過程。因此，盡管是熱傳導性較差的物料，也可以在短的時間內達到烘烤溫度。由于含有水分的物質容易吸收微波而發熱，因此除少量的傳輸損耗外，幾乎無其它損耗。故熱效率高、節能。它比滾筒式節能1/3以上。微波殺菌可分為包裝后殺菌和包裝前殺菌。
